鱼蛋白肥料制作前：需准备低脂鱼，发酵菌，种蒜瓣，光合菌，枯草芽孢杆菌，放线菌，酶以及苦皮藤根。建议准备的肥料需要按照一定的比例。将一切肥料准备好之后，开始将低脂鱼打成鱼浆。
打成鱼浆之后，需去除其他杂质，再将苦皮藤根磨成细粉，将所有肥料放到发酵罐内，并且放入纯净水。
此刻将事先准备好的发酵菌直接放入发酵罐中，不断搅拌均匀，再将所有准备的材料开始发酵，而发酵罐里面的温度保持在40~45度之后，再开始通风透气。一般通风透气需11~13个小时，在通风透气期间需要再次搅拌。
在通风透气期间，对发酵原料定期间隔的通气，通气时间各有不同，间隔时间在40~80分钟左右。每次通气时都需要搅拌，大概搅拌10~20分钟的样子，一般发酵3~8天可以得到鱼蛋白肥料。
